Нанокостюм (англ. Nano Muscle Suit) — вымышленное техническое приспособление, силовой экзоскелет, при работе использующий нанотехнологии.

Основная особенность нанокостюма — это его режимы работы, дающие человеку-оператору определенные возможности. В игре Crysis 2 нанокостюм был обновлен до версии 2.0. В этой версии изменены внешний вид и режимы (в игре были переработаны режимы, подробнее смотрите ниже). В нанокостюме 2.0 присутствует система обратной адаптивной биологической связи и улучшенный искусственный интеллект, что доводит контакт с оператором до симбиоза. Это самая сложная боевая система из созданных.

Время работы режимов ограничено запасом энергии, который перезаряжается только при отключении всех режимов.

Режимы нанокостюма:
Мощь — объединение режимов «сила» и «скорость» из первой части игры. Он стал пассивным, что делает игру более эргономичной. Если в Crysis каждый режим приходилось включать вручную, то во второй части это делается "на ходу": бег, усиленный прыжок, усиленная рукапашная атака (поглощают энергию до нуля, но можно перемещать автомобиль пинком), скольжение с разбега, захват, бросок предмета происходят при нажатии или удерживании определённых кнопок.
Защита — переработанный режим защиты из первой части. Делает костюм пуленепробиваемым, но при нанесении урона расходуется энергия. Теперь он стал более удобным, и предоставляет гораздо большее преимущество в бою.
Невидимость — делает человека-оператора невидимым. Во второй части игры этот режим предоставляет гораздо большие возможности стелса по сравнению с оригиналом. Например, в режиме невидимость игрок может незаметно убить противника со спины. Или выстрелить из оружия с глушителем и остаться невидимым (потеряв 20% энергии; выстрел без глушителя отнимает все 100).
Тактический визир — аналог бинокля из оригинала, но обладает расширенными возможностями. С его помощью можно высматривать врагов, оружие, боеприпасы, баллоны с химикатами (и узнавать их содержимое), "тактические возможности" (подсказки от игры) и даже исторически значимые вещи. Отмеченные в этом режиме объекты остаются отмеченными и после отключения; энергия не расходуется, но оружие опускается.
Нановизор - подвид тактического визира, по сути дела - тепловизор. Расходует энергию со временем.

В миссии «Верность или Смерть» Джейкоб Харгрив говорит игроку при помощи связи, что нанокостюм 2.0 стоит около 1 000 000 000 долларов. Из-за способности регенерировать здоровье игра лишена аптечек. Нанокостюм в игре обладает возможностью усовершенствования при помощи модулей (которые покупаются за нанокатализатор, собранный с трупов пришельцев). В каждом режиме есть определенные модули. На любой режим можно поставить только 1 модуль.

Список модулей костюма:
Режим «мощь»:
Мобильность - повышение скорости за счет большего потребления энергии.
Акробатика - дополнительный контроль над телом во время падения.
Атака сверху - мощная сотрясающая атака по земле.
Режим «защита»:
Оптимизация защиты - уменьшение потребления энергии в режиме «защита».
Регенерация - ускорение регенерации жизни и энергии.
Отклонение пуль - изменение траектории полета пуль.
Режим «невидимость»:
Глушение шагов - приглушение звуков ваших шагов.
Следопыт - отображение следов противника.
Фантом - ускорение входа и выхода из невидимости, уменьшение расхода энергии.
Режим «тактический визир»:
Отслеживание угроз - показ траектории пролетающих пуль.
Контроль обстановки - звуковое предупреждение о приближении противника.
Детектор маскировки - возможность видеть других «невидимок».

Все эти модули доступны в одиночной игре.